一、合理选择品种：差异微生物产物有差异的功效，畜禽机体内情况的pH值、菌群比例、菌群种类均有差异的需求。在畜禽痊愈后，由于熏染差异种类疾病对机体损伤水平以及体内微生物的平衡度也差异，所以使用前要充实了解菌种的功效和种类，使疗效到达最佳。

二、生存情况要求：情况中的水分、温度、湿度以及光照等都能对微生物制剂带来严重的影响，如果在高温、高湿的情况中很有可能造成微生物制剂的二次发酵，或影响到其代谢产物和营养物质的生存，从而降低微生物的功效。

三、生存时间要求：由于微生态制剂一直都在发生生物性变化，活菌率在生存历程中也会有差异水平的降低，因此，生存时间越短越好。

四、与抗生素谨慎配伍：微生态制剂的疗效在于活菌率，而抗生素多数具备广谱抗菌作用，极易使微生物失去活性，因此在与抗生素同天使用时，最好间隔2个小时以上。