科学家提出深度进修框架用永乐高官网进入-在发现癌症中的新突变

日期：2022-07-12 来历：本站 供稿：医药生物技术处 作者：治理员 种别：译文

全基因组染色质构象捕捉技术（Hi-C技术）已经被证实是检测人类基因组中结构变异（SVs）的一种有用要领。然而，今朝可以或许利用Hi-C数据举行全规模检测SVs的算法一直缺少。今朝的要领只能于不太理想的分辩率下，辨认染色体间易位及长间隔染色体内SVs（ 1 Mb）。美国西北年夜学范伯格医学院研究职员基在深度进修及集成进修战略，提出了一个全新的捕捉癌症基因组中SVs的盘算框架。该论文在近日发表于《Science Advances》杂志上，题为：EagleC: A deep-learning framework for detecting a full range ofstructural variations from bulk and single-cell contact maps。 研究职员开发了一个联合了深度进修及调集进修战略的框架（EagleC），以高分辩率推测全基因组规模的SVs。实验结果注解，该战略可以捕捉一组被全基因组测序或者纳米孔漏掉的融会基因。此外，该战略另有能经由历程其他染色质构象捕捉技术有用地捕捉SVs。他们于100多个癌细胞系及原发肿瘤中运用，并确定了数千个有价值的SVs。 综上，这类基在深度进修、使用染色质构象捕捉技术辨认SVs的盘算框架，对于辅助癌症靶向医治具备潜于的运用价值。 论文链接：https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abn9215 注：此研究结果摘自《Science Advances》期刊，文章内容不代表本网站不雅点及态度，仅供参考。-永乐高官网进入-